战国、秦汉时期，黄姓已经大批播迁到湖北地区，逐渐形成江陵、江夏两个著名黄氏郡望，以此为基地向江南发展，“浮诸江南，以实海滨”，黄姓的足迹已经西达陕西和四川，东临东海，南入湖南和江西。东晋末，中原的林、黄、陈、郑四大姓率先进入福建。隋唐时期，黄姓主宗分流，有了新的向南发展的行动。一支由江夏向东南迁移，穿过江西，进入浙江，在金华地区形成了历史上著名的金华黄氏。另一支先由江夏北迁河南固始，再向南经安徽、江西，抵达福建邵武，这是历史上著名的邵武黄氏。其子孙很快分散到东南沿海地区和广东。由湖北迁到广西的黄姓与当地的土著结合形成了今天壮族及湘黔地区布依族、侗族等民族中的黄姓先民。一部分进入越南，成为当地的大姓。黄姓进入台湾地区是在明末。
由于黄姓主体早在秦汉时期已迁离了北方，中国北方几次战乱对黄姓的伤害相对要轻些，而在南方得到稳定长足的发展，尤其在宋元时期，黄姓在赣浙闽粤四省繁衍最盛，最终形成了今天典型的南方大姓。
宋朝时期，黄姓大约有120万人，约占全国人口的1.6%，为宋朝第九大姓。黄姓第一大省是江西，约占全国黄姓人口的四分之一强。主要分布于江西和福建，这两省黄姓大约占全国黄姓人口的53%；其次分布于浙江、四川、广东、河南，这四省集中了黄姓总人口的24%。全国形成了以赣浙、闽粤、四川、河南为中心的四大块黄姓聚集地。
明朝时期，黄姓大约有220万人，约占全国人口的2.3%，为明朝第七大姓。仍主要分布于江西、福建两省，大约占黄姓总人口的40%；其次分布于广东、广西、浙江三地，又集中了黄姓总人口的30%。宋元明600余年，黄姓人口主要向东南和南方地区迁移，而四川地区黄姓人口主要向两广和湖南地区流动。全国重新形成了赣浙、闽粤桂两大块黄姓人口聚集区，重心由东南部转向南部。